高等教育自學(xué)考試的主考學(xué)校是由省考委遴選的專業(yè)師資力量較強(qiáng)的全日制普通高等學(xué)校。主考學(xué)校在高等教育自學(xué)考試工作中接受省考委的領(lǐng)導(dǎo)，參與計(jì)劃制訂、教材編寫、命題和評卷等，負(fù)責(zé)有關(guān)實(shí)踐性學(xué)習(xí)環(huán)節(jié)的考核，在畢業(yè)證書上副署校印，并辦理省考委交辦的其他有關(guān)工作。

自考中每一專業(yè)對應(yīng)一個(gè)主考院校，但也有個(gè)別專業(yè)，?？贫魏酮?dú)立本科段是由不同的學(xué)校來主考的，把所學(xué)專業(yè)全部通過并經(jīng)過畢業(yè)論文答辯合格后就頒發(fā)主考院校的畢業(yè)證書，但并不等于只有主考院校能開設(shè)這個(gè)專業(yè)的學(xué)習(xí)，只要具有高等教育資質(zhì)的學(xué)校，經(jīng)當(dāng)?shù)厥】嘉鷾?zhǔn)后可開設(shè)由其他學(xué)校主考的專業(yè)。

目前我省高等教育自學(xué)考試的主考學(xué)校有：南京大學(xué)、東南大學(xué)、南京師范大學(xué)、南京航空航天大學(xué)、南京理工大學(xué)、河海大學(xué)、蘇州大學(xué)、南京財(cái)經(jīng)大學(xué)、揚(yáng)州大學(xué)等30余所高等院校。